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立命館大学　研究者学術情報データベース English>> TOPページ TOPページ > 北沢　創一郎 （最終更新日 : 2024-02-14 17:39:06） キタザワ　ソウイチロウ 北沢　創一郎 KITAZAWA SOICHIRO 所属 薬学部 薬学科 職名 助教 業績 その他所属 プロフィール 学歴 職歴 委員会・協会等 所属学会 資格・免許 研究テーマ 研究概要 研究概要（関連画像） 現在の専門分野 研究 著書 論文 その他 学会発表 その他研究活動 講師・講演 受賞学術賞 科学研究費助成事業 競争的資金等(科研費を除く) 共同・受託研究実績 取得特許 研究高度化推進制度 教育 授業科目 教育活動 社会活動 社会における活動 研究交流希望テーマ その他 研究者からのメッセージ ホームページ メールアドレス 科研費研究者番号 researchmap研究者コード 外部研究者ID 学歴 1. ～2014/09 立命館大学院 理工学研究科 総合理工学専攻 博士後期課程 修了 博士（理学） 2. ～2009/03 立命館大学 理工学部 応用化学科 卒業 3. ～2011/03 立命館大学院 理工学　研究科 創造理工学　専攻 博士前期課程 修了 職歴 1. 2016/04/01 立命館大学 薬学部 2. 2015/10/01 ～ 2015/11/30 立命館大学 総合科学技術研究機構 3. 2015/02/15 ～ 2016/03/15 レンセラー工科大学 所属学会 1. 日本核磁気共鳴学会 研究テーマ 1. 高圧力NMR法によるリン酸化Ubiquitinの構造揺らぎ機能相関研究 研究概要 Thr/SerキナーゼであるPINK1及びParkinの機能不全は、異常ミトコンドリアを蓄積し、パーキンソン病を発病する。Ubiquitin (UB)は、PINK1により、S65にリン酸化修飾を受ける。リン酸化UB(pUB)とParkinのリン酸化UB様ドメイン(pUBL)は、E3リガーゼであるParkinを活性化させ、ミトコンドリアの品質管理に関わる (Iguchi et al. JBC 2013, Koyano et al. Nature 2014) 。興味深いことにリン酸化模倣変異体S65D・S65Eは、PINK1をバイパスし、Parkinを活性化する (Koyano et al. Nature 2014)。 pUB-Parkin複合体の結晶構造は、自己阻害活性を有するRING0ドメインが外れ、Parkinの活性中心であるC431が露出する (Wauer et al. Nature 2015) 。これはKoyanoらのParkin活性化機構モデルを支持し、pUB-Parkinの相互作用機構解明に注目が集まっている。興味深いことに、pUBはふたつのconformationがおよそ7:3で存在し、構造的に揺らいでいる (Wauer et al. EMBO 2015, Fig. 1) 。X線結晶構造解析により、pUBのMajor構造は非リン酸化UBとほぼ同一である。一方、Minor状態の原子座標は、化学シフト値解析・水素結合ペアの解析などにより、b5-strandとb1-strand・b3-strand間の水素結合パターンが2残基分スライドする。これらのb-strandは、UB表面に疎水性パッチを形成し、多数のタンパク質と相互作用する活性中心である。そのため、分子間相互作用やpoly-UBへ影響すると予測される。興味深いのはpUB-Parkin複合体のpUBの構造はMajor構造とほぼ同一である点だ。これから単純なタンパク質-タンパク質相互作用モデルである”鍵と鍵穴モデル”で考えるなら、構造変化を伴うMinor状態は、複合体形成を阻害すると予測され、機能的存在意義に合理性が欠ける。UBの構造揺らぎとpUB-Parkinの相互作用機構を明らかとすることは、ミトコンドリアの品質管理によるパーキンソン病抑制機構の解明につながると期待される。　UBは幅広い時間スケールの構造揺らぎが発見されている。それらとpoly-UB化やATP依存的なタンパク質分解などの機能発現機構との関連性は不明な点が多い。PINK1によるUBのリン酸化修飾とpUBがParkinを活性化する機構の発見は、単にパーキンソン病発病機構の解明だけではなく、改めてUBの構造揺らぎと機能相関研究に注目が集まるきっかけとなった。応募者の行う高圧力NMR法は、数パーセントの僅かな存在確率しかない状態でも、conformation平衡を大きく変化させ、一原子分解能で測定できる強力な手法である。そのため存在確率が小さいpUBのMinor状態やリン酸化模倣変異体のconformation研究に適している。　リン酸化模倣変異体のMinor状態が発見されれば、Parkinの分子認識機構において、Minor状態の重要性が示唆される。さらにParkinによるpoly-UB鎖形成をpUBとリン酸化模倣変異体で比較することによりその機能的意義を明らかにする。 現在の専門分野 分子生物学, 構造生物化学, 生物物理学, 物理系薬学, 創薬化学 (キーワード：構造生物学、構造揺らぎ、NMR、タンパク質) 論文 1. 2019/09 Paramagnetic relaxation enhancement-assisted structural characterization of a partially disordered conformation of ubiquitin │ Protein science │ 29,1993-2003 (共著)   2. 2019/08 Pressure accelerates the circadian clock of cyanobacteria │ Scientific Reports │ 9,12395 (共著)   3. 2019/05 Gene delivery to cone photoreceptors by subretinal injection of rAAV2/6 in the mouse retina. │ Biochemical and Biophysical Research Communications │ 515,222-227 (共著)   4. 2018/09 Water-Protein Interactions Coupled with Protein Conformational Transition. │ Biophys J │ 18 (115),981-987 (共著)   5. 2017/08 Interactions Controlling the Slow Dynamic Conformational Motions of Ubiquitin. │ Molecules │ 22 (9),E1414 (共著)   全件表示（7件） 学会発表 1. 2022/12/13 圧力摂動とアミノ酸変異による変性中間体を模倣した変異体の設計 と構造研究 (第63回高圧力討論会) 2. 2022/03/30 Amplification of the Specific Conformational Fluctuation of Outer Surface Protein A by Mutagenesis and Hydrostatic Pressure 3. 2020/07/28 Water-amide proton exchange coupled with protein conformational transition studied by high-pressure NMR (第20回日本タンパク質学会年会) 4. 2020/03/28 極限環境と概日時計 (日本薬学会第140回) 5. 2020/03/27 高圧力NMR法によるユビキチンのコンフォメーション変化に伴う水和状態に関する研究 (日本薬学会第140回) 全件表示（19件） 科学研究費助成事業 1. 2017/04 ～ 2019/03 Parkinを活性化させるリン酸化Ubiquitinの構造揺らぎ機能相関研究 │ 若手研究(B)   © Ritsumeikan Univ. All rights reserved.